Powstał w 1998 r. z przekształcenia uniwersalnego HypoBank Polska S.A w specjalistyczny HypoVereinsbank Bank Hipoteczny SA
Pierwszy bank hipoteczny w Polsce, któremu Komisja Nadzoru Bankowego przyznała zgodę na rozpoczęcie działalności jako banku specjalistycznego
25 listopada 2004 roku Sąd Rejonowy w Warszawie Wydział XIX Gospodarczy Krajowego Rejestru Sądowego, zarejestrował zmianę nazwy banku. Dotychczasowa nazwa Hypovereinsbank Bank Hipoteczny Spółka Akcyjna została zastąpiona nazwą BPH Bank Hipoteczny Spółka Akcyjna
31 lipca 2008 roku Sąd Gospodarczy w Warszawie dokonał wpisu do Krajowego Rejestru Sądowego nowej nazwy banku - Pekao Bank Hipoteczny S.A.
Jest bankiem specjalistycznym działającym głównie w oparciu o Ustawę o listach zastawnych i bankach hipotecznychoraz Ustawę Prawo bankowe
Jest częścią międzynarodowej Grupy UniCredit, a w Polsce wchodzi w skład Grupy Kapitałowej Pekao.